Model Škoda Fabia byl představen veřejnosti v roce 1999 ve verzi hatchback. Byl přímým nástupcem vysloužilého odelu Felicia, kterého postupně nahradila ve výrobě. V roce 2000 byla představena karosářská verze combi a o rok později i sedan.
Do vozu se montovala široká nabídka jak zážehových, tak vznětových motorů s obsahem 1.0 až 2.0 litru a výkonem 37-96 kW. Základní výbava Junior se dodávala s nelakovanými nárazníky a airbagem řidiče. Protiblokovací systém ABS se pak dodával pouze se silnějšími motory.
Sportovní varianta vozu RS představená v roce 2003, byla osazena vznětovým motorem o obsahu 1.9 litru a výkonu 96 kW. Byla tak první Fábií která přesáhla papírovou hranici rychlosti 200 km/h. Rozsáhlou standardní výbavu pak umocňovala cena pohybující se pod hranicí půl milionu korun. V roce 2004 došlo k lehkému faceliftu, při němž vůz dostal nový přední nárazník, inovovaná zadní světla a volant z Octavie. Lehce pozměněna byla i přístrojová deska kde byl použit nový design.