EMDR terapie je efektivní zejména u lidí, kteří byli vystaveni nadlimitní zátěží, jako jsou například oběti trestných činů (fyzického napadení, znásilnění, únosu, loupeže), účastníci závažných dopravních nehod a jiných závažných událostí, v jejichž důsledku se rozvinula posttraumatická stresová porucha. Psychoterapeutickou metodu EMDR lze však využít i u dalších psychických potíží, u kterých se předpokládá, že vznikly v důsledku nezpracovaných životních událostí, jako jsou úzkostné poruchy, depresivní stavy, komplikované truchlení, nedostatek vlastní hodnoty či pro posílení výkonu a pozitivních emocí. EMDR terapie je tak velmi efektivní způsob, jak zvládnout psychické potíže a bloky.